- _ -

• __mccl_tolwr() : mutil.cc , mutil.h
• __mccl_toupr() : mutil.cc , mutil.h

- a -

• AddUTF8Sig() : mutil.cc , mutil.h
• After() : StringUtil.cc , StringUtil.h
• azure() : Color.h

- b -

• Before() : StringUtil.cc , StringUtil.h
• BinSearch() : SVector.h
• BinSearchFuzzy() : SVector.h
• black() : Color.h
• blue() : Color.h

- c -

• CompareSubstring() : MakeDepend.cc
• Contains() : StringUtil.cc , StringUtil.h , StringUtil.cc , StringUtil.h
• ContainsAt() : StringUtil.cc , StringUtil.h
• cyan() : Color.h

- d -

• darkergray() : Color.h
• darkgray() : Color.h
• Draw() : Plot3D.cc
• DrawOne() : GeneExpression.cc

- f -

• FindChr() : ChromosomePaint.cc

- g -

• GetColor() : ChromosomePaint.cc
• GetMemoryManager() : mutil.cc
• GetNextToken() : mutil.cc , mutil.h
• GetUTF8Sig() : mutil.cc , mutil.h
• Gradient() : Color.h
• GradientMult() : Color.h
• gray() : Color.h
• green() : Color.h

- h -

• HexToColor() : Color.cc

- i -

• IsSpace() : MakeDepend.cc
• IsUTF8() : mutil.cc , mutil.h

- l -

• lightergray() : Color.h
• lighterpink() : Color.h
• lightgray() : Color.h
• limegreen() : Color.h
• lock_reg() : checkLock.c
• lock_test() : checkLock.c

- m -

• magenta() : Color.h
• main() : MakeDepend.cc , Plot3D.cc , checkLock.c , ChromosomePaint.cc , Plot3DStructure.cc , GeneExpression.cc , HeatMaps.cc , DrawCompounds.cc , DrawDensity.cc , ShowColorScale.cc
• MakeUpColor() : Color.cc , Color.h
• MCLIsUTF8Encode() : mutil.cc , mutil.h
• MCLSetCasing() : mutil.cc , mutil.h
• MCLSetUTF8Encode() : mutil.cc , mutil.h
• MLog() : mutil.h , mutil.cc , mutil.h
• mlog() : mutil.h , mutil.cc
• MLog() : mutil.h , mutil.cc

- n -

• NowTime() : log.h

- o -

• OneFrame() : Plot3DStructure.cc
• operator<<() : Color.cc
• orangered() : Color.h

- p -

• pink() : Color.h
• PositionAfter() : StringUtil.cc , StringUtil.h
• print_trace() : ErrorHandling.cc
• PrintEpsHeader() : Eps.cc , Eps.h

- r -

• ReadHeader() : ChromosomePaint.cc
• red() : Color.h
• RemoveUTF8Sig() : mutil.cc , mutil.h

- s -

• seashell() : Color.h
• SetLogSink() : mutil.cc , mutil.h
• SetMemoryManage() : mutil.cc , mutil.h
• Smooth() : GeneExpression.cc
• Sort() : SVector.h
• Stringify() : StringUtil.h

- t -

• ThrowError() : ErrorHandling.h
• ThrowException() : mutil.cc , mutil.h , mutil.cc , mutil.h
• Tokenize() : StringUtil.cc , StringUtil.h , mutil.cc , mutil.h

- u -

• UniqueSort() : SVector.h

- w -

• wheat() : Color.h
• white() : Color.h

- y -

• yellow() : Color.h